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从生物学或化石方面的论证，爬行类无疑是起源于两栖类，特别是迷齿亚纲最接近于爬行纲的祖先。
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爬行纲动物蜥蜴
最早的爬行类化石见于上石炭统下部，即杯龙类的Hylonomus。但其具体特征与迷齿类对比，还不是很理想。从比较解剖学出发，发现于美国德克萨斯西蒙城下二叠统的Seymouria(蜥螈或名西蒙螈)倒是介于爬行类和两栖类之间的过渡型。Seymouria的头骨及牙齿保持了两栖类的特点，而头后的骨骼则具有爬行类的特点。由于Seymouria的出现时间太晚，已不可能是爬行类的祖先了。
从最早的含有爬行类化石的地层上石炭统中便已见到有大鼻龙类、阔齿龙类、盘龙类和中龙类许多类群，这说明爬行动物在晚石炭世之前早已分支进化了，它们有可能是多源起源。再经过二叠纪的分支进化，爬行纲的各亚纲均已出现，为中生代爬行类的大发展打好了基础。中生代开始它们不仅横行于大陆，而且还占领了天空和水域。中生代的中期分支进化出的种类更是多种多样，很多类群更发展成庞然大物。在当时的地球上，它们是占居绝对统治地位的动物。所以中生代被称为“爬行动物时代”，又叫做“恐龙时代”。侏罗纪和白垩纪是巨大爬行动物——恐龙的兴旺时期。它们不仅个体发展得特大，而且体态乃至食性也非常特化。在白垩纪末期，这些在地球上经历了1亿多年的庞然大物终于绝灭了。渡过中生代而又残存到新生代的只有龟鳖类、鳄类和有鳞类(蜥蜴和蛇)，而很少的喙头类可以看做是爬行类的活化石。
外形特征
爬行纲(Reptilia)生物的头骨全部骨化 ，外有膜成骨掩覆，以一个枕髁与脊柱相关联，颈部明显，第一、二枚颈椎特化为寰椎与枢椎，头部能灵活转动，胸椎连有胸肋，与胸骨围成胸廓以保护内脏（这是动物界首次出现的胸廓）腰椎与两枚以上的荐椎相关联，外接后肢 。除蛇类外 ，一般有两对5出的掌型肢（少数的前肢4出） ，水生种类掌形如桨 ，指、趾间连蹼以利于游泳，足部关节不在胫跗间而在两列跗骨间，成为跗间关节 。四肢从体侧横出 ，不便直立 ；体腹常着地面，行动是典型的爬行；只有少数体型轻捷的爬行动物能疾速行进。
在爬行动物中，蛇是特殊的一类。蛇没有胸椎，不连胸肋，因此蛇能吞噬比自己大很多的物体。蛇没有脚，依靠鳞片快速爬行。
生活习性
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爬行动物的排泄系统是如何运行的？
爬行动物在活动季节每天的活动情况也表现出一定的规律性。一般来说，可分为昼出活动、夜出活动和晨昏活动三种。
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爬行纲
爬行动物和两栖动物一样，没有完善的保温装置和体温调节功能，能量又容易丧失，需要从外界获得必需的热，为所谓的“外热源动物”。它们通过自己的行为，可以在一定程度上调节自己的体温。比如，移动到有阳光照射的地方晒太阳取暖，可以使体温升高；藏到树荫下或者躲入洞穴中，可以使体温降低。在四季分明的地区，爬行动物一年的活动规律也显出季节差异：夏季是活动季节，摄食和繁殖多在此期间进行；秋末冬初到次年春季是休眠时期，或称“冬眠”。
除了气温因素外，爬行动物的活动也与食物的丰富程度有关系，如蛇岛蝮。蛇岛蝮依赖春末夏初和秋末冬初南来北往经过蛇岛停歇的鸟类为主要食物，所以蛇岛蝮每年5～6月及9～10月有两次活动高峰，在两次活动高峰之间则由于食物缺乏而出现“夏眠”现象。
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